Faltung und Stabilität von Außenmembranproteinen am Beispiel des hVDAC-1 Kanals (Mensch) und des Außenmembranproteins A (E.coli)

Description

Die Insertions- und Faltungsmechanismen polytoper Außenmembranproteine von Mitochondrien bzw. von Gram-negativen Bakterien werden am Beispiel des Spannungs-abhängigen, Anionen-selektiven Kanals (hVDAC-1) und des Außenmembranproteins A von E.coli mit biophysikalischen Methoden untersucht und verglichen. Sowohl die eukaryotischen als auch die prokaryotischen Außenmembranproteine weisen ß-Faltblatt Sekundärstruktur, aber keine Aminosäuresequenzhomologie auf. In kinetischen Messungen zur Faltung von hVDAC-1 wird mit der Fluoreszenz- und der CD-Spektroskopie festgestellt, ob es Faltungsintermediate gibt und wovon die Kinetik der Membranproteinfaltung abhängt. Es wird untersucht, wie die stark unterschiedlichen Zusammensetzungen der mitochondrialen Außenmembran bzw. der Außenmembran von Bakterien die Stabilität von hVDAC-1 und Außenmembranprotein A beeinflussen. Basierend auf eigenen Vorarbeiten wird der Mechanismus der Protein-assistierten Faltung bakterieller Außenmembranproteine mit Hilfe von ortsgerichteten Fluoreszenz- bzw. Spin-Label-Markierungen und der Fluoreszenz- bzw. der Elektronenspinresonanz-Spektroskopie analysiert. Die Protein-Protein-Wechselwirkungen im Proteinkomplex sowie die Protein-Lipid Wechselwirkungen beim Membraneinbau werden mit spektroskopischen Methoden charakterisiert.

Participants
  • Kleinschmidt, Jörg - Project leader
Institutions
  • Department of Biology
Funding sources
Name Finanzierungstyp Kategorie Project no.
Deutsche Forschungsgemeinschaft third-party funds research funding program 643/03
Further information
Period: 01.11.2003 – 31.10.2005